本专业培养的学生具备数学、自然科学和生物工程专业基础知识、基本理论和基本技能；能够运用所学知识和原理，识别、表达、分析和解决生物工程生产中的复杂工程问题；能够理解生物产业对于环境和可持续发展的责任；具备良好的职业道德和高度的社会责任感，具备良好的沟通、交流和协调能力；能够在生物工程、生物化工、食品及生物医药等相关企业、科研院所和高等学校从事技术开发、工程设计、检验检疫、生产管理、产品营销、科学研究和教育教学等工作。毕业生是具有生物工程专业发展、继续深造、终身学习、国际视野、创新精神和一定国际竞争能力的高级专门人才。
本专业为全日制四年学制，本科毕业生可授予工学学士学位；在生物化学与分子生物学学科具有理学硕士学位授予权；在生物工程专业领域具有工程硕士学位授予权。
主要课程：无机及分析化学、有机化学、物理化学、化工原理、机械设计基础、工程制图基础、生物工程导论、普通生物学、细胞生物学、生物化学、分子生物学、微生物学、生物工艺学、生物分离工程、生物工业分析、基因工程、生物工程设备、生物工厂设计基础和生物制药技术等。
主要实践性教学环节：金工实习、化工原理课程设计、生物化学实验、微生物实验、生物工艺学实验、生物分离工程实验、生物工业分析实验、基因工程实验、生物工厂课程设计、开放实验、科研创新训练、专业产品设计、认识实习、生产实习和毕业设计（论文）等。
